這是食用花粉幾乎立竿見影的一大特點。人類的腸臟呈複雜性彎曲，食物下肚，吸收了養分，剩下的殘渣，經過漫長的腸道，通向肛門而排出人體外。但由于人糞有很強的吸附力，往往不很通暢，加以人體內的異物，致使腸內的有害細菌，不斷産生毒素，如糞便不能及時排出體外，對人的健康影響極大。因此預防便秘是一個必須經常注意的問題。

中國漢代著名養生學家王充有幾句名言：“欲得長生，腸中常清；欲得不死，腸中無糠。”

花粉中的營養物質，能促進胃液正常分泌，使消化系統機能保持良好狀態。花粉中的酶，能使腸胃分泌天然乳酸，使腸臟保持正常蠕動，而糖能增加人體腸道的益生菌，抑制有害菌的生長，這一切都有利于大便暢通，因此對頑固性便秘效果尤佳。對萎縮性胃炎也有一定的功效。花粉還有助于止痢疾。患痢疾者食用花粉，可收到顯著效果。